2. 中国热带农业科学院科技信息研究所,海南省唐华俊院士工作站,海南海口 571101
2. Hainan Tang Huajun Academician Workstation, Institute of Scientific and Technical Information, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan, 571101, China
木薯(Manihot esculenta)为大戟科(Euphorbiaceae)多年生作物,广泛栽植于南美洲、非洲和亚洲的热带及部分亚热带地区。其块根含有丰富的淀粉,成为人类重要的主食来源,为全球约8亿人提供了主要的能量和营养[1]。比外,木薯也被用作动物饲料和工业原料,用于生产淀粉和可生物降解材料[2]。在我国,木薯被定义为非粮能源作物,在饲用和工业原料运用领域发挥重要作用[3]。然而,我国木薯产量尚未满足需求,对外依存度达81.91%[4]。在种植中,木薯繁殖主要依赖茎切段扦插的方式进行,然而该方法往往加剧了病虫害传播[2, 5],严重影响了木薯产量。病虫害已成为木薯生产中的重要限制因素。基于此背景,系统分析我国木薯病虫害领域的科技文献具有重要意义,这不仅能够评估现有成果,还能为未来的研究方向提供参考。目前,已有学者对我国木薯病虫害研究进行了梳理。如丘海峰[6]回顾了木薯细菌性枯萎病在检疫鉴定、防治措施等方面的研究进展。曾小荣等[7]简要介绍了木薯细菌性枯萎病、细菌性角斑病、木薯褐斑病、木薯花叶病毒病、枯萎叶斑病、木薯朱砂螨、白蛴螬、蔗根锯天牛、地老虎等的危害症状及防治措施。时涛等[4]系统回顾了我国木薯病害的发展历程,并从木薯病害普查及监测技术、木薯细菌性萎蔫病监控技术、花叶病监控技术等方面系统梳理了相关的研究现状。然而,前两者文献报道的时间较早,相关进展亟待更新;后者对近期木薯病害领域进行了系统性回顾,但仅聚焦于我国木薯病害的定性分析。若能引入定量研究方法,将有助于验证和深化现有结论,从而为木薯病害防控策略的制定和科学研究提供更充分的数据支持。
文献计量作为一种专注于文献可观测特征的定量分析方法,能够对特定研究领域的整体趋势和发展态势进行全面分析,并结合可视化分析技术,揭示研究领域知识结构全图景。值得注意的是,相较侧重关注研究文章具体内容的传统文献综述,文献计量更偏向于数据挖掘及可视化的部分,旨在对某一领域形成宏观了解,揭示研究的协作网络和有影响力的期刊、文章及重点研究领域的主题[8]。目前,已有学者利用文献计量学分析方法对木薯研究领域的知识图景进行剖析。黄武等[9]利用CiteSpace等可视化技术展示了全球木薯研究领域的知识图景,发现木薯淀粉、燃料乙醇、木薯病毒等成为该领域持续关注的研究热点。李菊馨等[10]运用文献计量手段探究了国内木薯研究领域现状,结果显示木薯基因的克隆与表达、朱砂叶螨(Tetranychus cinnabarinus)、木薯品质、木薯饲用等为近年来学者关注的重点。然而,尚未见运用文献计量学手段分析我国木薯病虫害领域的研究报道。本研究基于中国知网(CNKI)和Web Of Science(WOS),运用文献计量分析法对我国木薯主要病虫害研究态势展开分析,一方面为关注木薯病虫害研究相关机构和学者提供数据支持和见解;另一方面为开展领域文献计量标准化分析提供思路借鉴。
1 材料与方法 1.1 数据来源本研究中文文献数据来源于CNKI学术期刊数据库(中文),外文文献数据来源于WOS的Science Citation Index Expended(SCI-E)数据库,依照数据可获得性原则,中文文献出版年跨度选择1915年至今,外文文献出版年跨度选择1900年至今,检索时间为2024年1月5日。依照中英文数据库平台的设计差异,制定不同的检索策略,其中,中文数据库采用两种检索策略进行检索,即策略一为SU=(“木薯”OR“树薯”) AND CLC=S4;策略二为SU=(“木薯”OR“树薯”),文献分类=植物保护。英文数据库检索策略为TS=((“cassawa”OR“cassava”OR“manihot”OR“manihoc”) AND (“disease*”OR“agen*”OR“pathogen*”OR“insect*”OR“mite*”OR“pest”OR“virus”OR“bacteria*”OR“fung*”)) AND AD=(“China”OR“Chinese”)。纳入本研究讨论的文献类型为研究型文献和综述类文献,最终检出中文相关文献409篇,英文相关文献453篇。依据“DEAN”流程[11]进行数据清洗,最终获得可分析文献327篇,其中,中文文献225篇,英文文献102篇。
1.2 方法本研究遵循文献计量领域一般研究范式展开分析[8],对研究文献出版趋势、研究机构、研究著者、期刊数据、关键词等知识单元进行分析和整合,从而揭示科研合作网络格局、权威期刊分布及核心研究主题,主要运用的方法如下。
(1) 数理统计及可视化分析。本研究通过文献计量法对所检文献的外部指标进行统计分析,采用Excel软件进行数据统计,选用VOSviewer软件和SPSS软件进行可视化分析。
(2) 共词分析法。本研究通过识别和统计文献中的关键词共现频率来构建共现矩阵,采用Bicomb软件对选定的文献集进行关键词提取,创建词篇矩阵。并将词篇矩阵置入SPSS软件中进行聚类分析,以期识别当前的研究焦点并预测可能的研究方向,绘制战略坐标图。
2 结果与分析 2.1 文献产出趋势分析年度发文量是研究领域总体关注度的直观表征,一方面揭示研究领域的发展速度,另一方面直观展示研究领域的发展历程,有利于发现研究领域的周期性拐点。本研究分析结果如图 1所示,木薯病虫害领域的累积发文总体呈上升趋势,年度发文呈波动增长趋势,中文文献报道可追溯至1981年,外文文献报道可追溯至1997年。依据Loglet Lab4工具拟合的生命周期模型,该领域历经了初始期(1981—2002年)、发展期(2003—2016年)和快速发展期(2017年至今)3个阶段,每个阶段的发文量在总发文量中的占比分别为9.48%、36.70%和53.82%。总体来看,我国对木薯侵入性病虫害研究的关注度持续升高。
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| Initial stage: the phase where the cumulative number of publications is within the range of 0%—10%.Development stage: the phase where the cumulative number of publications exceeds 10%.Rapid growth stage milestone: the time point within the development phase at which the half of the peak cumulative publications is reached. 图 1 我国木薯主要侵入性病虫害研究领域发文年度趋势 Fig. 1 Annual distribution of study literatures on main diseases and pests of cassava in China |
2.2 研究力量布局分析 2.2.1 研究机构及作者分布
分析领域内主要的研究机构,可以快速了解领域研究的执行高地。表 1展示了木薯病虫害研究领域发文排名前10的机构信息。统计结果显示,木薯病虫害研究主要集中在中国华南片区,其中,中国热带农业科学院、海南大学总发文量占比分别为46.79%、27.83%,为木薯病虫害研究的主要执行机构。
| 机构 Institute |
区域 Region |
总发文量 Total number of publications |
中文文献 Chinese publications |
英文文献 English publications |
| Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences | Hainan | 153 | 122 | 31 |
| Hainan University | Hainan | 91 | 51 | 40 |
| Chinese Academy of Sciences | Beijing | 20 | 4 | 16 |
| Guangxi Academy of Agricultural Sciences | Guangxi | 16 | 16 | 0 |
| Zhejiang University | Zhejiang | 15 | 2 | 13 |
| Yunnan Academy of Agricultural Sciences | Yunnan | 15 | 13 | 2 |
| Guangxi University | Guangxi | 12 | 8 | 4 |
| Chinese Academy of Agricultural Sciences | Beijing | 9 | 2 | 7 |
| Hainan Yazhou Bay Seed Laboratory | Hainan | 7 | 0 | 7 |
| Zhongkai University of Agriculture and Engineering | Guangdong | 5 | 5 | 0 |
| Note: the above date involve cases of collaborative publication. | ||||
作者是开展领域研究的最小执行单元,对发文作者进行统计和共现关系分析,一方面反映行业内作者的影响力,另一方面有助于学者明晰领域内领先的研究团队。根据普赖斯理论(
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| The dot size indicates the number of publications.Line thickness indicates co-occurrence intensity, and color indicates clustering.★ indicates productive scholars within the clusters. 图 2 我国木薯主要病虫害研究领域作者网络 Fig. 2 Author network in the field of major diseases and pests of cassava in China |
2.2.2 文献来源期刊分布
期刊是报道领域研究成果的主要阵地,把握领域研究成果期刊分布状况,在为学者成果发布提供渠道指南以及科研资料参考的同时,也可以为办刊单位提供科技传播的方向。通过对木薯病虫害研究领域科技成果发布的期刊进行分析,发现中文文献涉及期刊68本,外文文献涉及期刊65本,载文量排名前10的期刊如表 2所示。据统计,中文文献载文量最多的刊物为《热带作物学报》,共有55篇;其次是《热带农业科学》和《植物检疫》。外文文献载文量最多的刊物为Frontiers in Plant Science;其次为Experimental and Applied Acarology和Plant Molecular Biology。从载文量排名前10的期刊质量来看,中文文献刊载期刊以北大核心为主,外文文献刊载期刊以中科院大类2区的期刊居多。
| 中文期刊 Chinese journal |
载文量 Number of publications |
北大核心* Chinese Core Journal Catalogue* |
英文期刊 English journal |
载文量 Number of publications |
中科院分区** Journal partitioning of Chinese Academy of Sciences** |
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| 《热带作物学报》 | 55 | Yes | Frontiers in Plant Science | 7 | Zone 2 | |
| 《热带农业科学》 | 30 | No | Experimental and Applied Acarology | 5 | Zone 2 | |
| 《植物检疫》 | 10 | No | Plant Molecular Biology | 4 | Zone 2 | |
| 《南方农业学报》 | 6 | Yes | Journal of General Virology | 3 | Zone 4 | |
| 《广西植保》 | 6 | No | Journal of Pineal Research | 3 | Zone 1 | |
| 《环境昆虫学报》 | 5 | Yes | Plant Biotechnology Journal | 3 | Zone 1 | |
| 《热带生物学报》 | 5 | No | Plant Physiology And Biochemistry | 3 | Zone 2 | |
| 《中国植保导刊》 | 5 | Yes | PLoS One | 3 | Zone 3 | |
| 《生物技术通报》 | 4 | Yes | Scientific Reports | 3 | Zone 2 | |
| 《分子植物育种》 | 4 | Yes | Frontiers in Microbiology | 2 | Zone 2 | |
| Note: * was from Chinese Core Journal Catalogue (2023 edition); ** was from the upgraded edition of the Journal Partitioning Table, National Science Library, Chinese Academy of Sciences (2023 edition). | ||||||
2.3 基于关键词共现的研究主题分析
文献中的关键词是研究主题高度凝练后的特征词,用于反映文献研究的方向。高频关键词通常用于揭示研究热点[12]。本研究利用Python实现CNKI和SCI-E源数据同义词消歧和结构化后,通过Bicomb软件进行关键词提取,排除检索关键词“木薯”,按照词频高低进行统计,根据词频二八定律理论[13],测算出词频大于4的关键词为高频关键词,具体如表 3所示。经分析发现,我国木薯病害重点研究对象包括细菌性枯萎病、木薯花叶病、木薯炭疽病、木薯褐斑病等;虫害包括朱砂叶螨、木薯单爪螨(Mononychellus mecgregori)、二斑叶螨(Tetranychus urticae)、木瓜秀粉蚧(Paracoccus marginatus)、烟粉虱(Bemisia tabaci)、木薯绵粉蚧(Phenacoccus manihoti)等。其中,二斑叶螨、木瓜秀粉蚧、木薯普通花叶病毒(CsCMV)平均出现年份均处于近5年的区间内,为近年来研究的热点关键词。
| 关键词 Key word |
平均发表年份 Average publication year |
频次 Frequency |
关键词 Key word |
平均发表年份 Average publication year |
频次 Frequency |
关键词 Key word |
平均发表年份 Average publication year |
频次 Frequency |
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| bacterial wilt disease |
2018 | 37 | Bemisia tabaci | 2017 | 8 | cassava germplasm |
2018 | 5 | ||
| Tetranychus cinnabarinus |
2014 | 24 | cassava variety | 2021 | 8 | cassava anthracnose |
2014 | 5 | ||
| bacterial blight | 2017 | 16 | gene expression | 2022 | 8 | cassava com- mon mosaic virus |
2021 | 5 | ||
| Mononychellus mecgregori | 2014 | 14 | development | 2015 | 7 | cassava brown leaf spot |
2016 | 5 | ||
| Tetranychus urticae |
2021 | 13 | biological charac- teristics |
2012 | 7 | quarantine | 2015 | 5 | ||
| disease resistance | 2020 | 11 | reproduction | 2015 | 6 | host plant | 2009 | 5 | ||
| virus-induced gene silencing |
2020 | 11 | African cassava mosaic virus |
2011 | 6 | genome | 2013 | 5 | ||
| cassava mosaic disease |
2017 | 11 | mite-resistant and mite-susceptible cassava cultivars |
2022 | 6 | transcription factor |
2020 | 5 | ||
| resistance | 2018 | 9 | protein-protein interaction |
2020 | 6 | disease index | 2018 | 5 | ||
| mite-resistance | 2019 | 9 | geminivirus | 2004 | 5 | |||||
| Paracoccus marginatus |
2019 | 9 | Phenacoccus manihoti | 2015 | 5 |
文献和关键词之间存在映射关系,不同的文献通过相同和相似的特征关键词建立联系,根据联系进行聚类分析,进而揭示词组背后所代表的研究领域的组成与范式,以实现对领域发展过程和演化结构的剖析。本研究以上述提取的关键词为对象构建词篇矩阵,进行SPSS系统聚类分析,结果如图 3所示。依据语义关系,我国木薯病虫害研究主要分为以下4个类别。
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| Dendrogram using average linkage (within group), rescaled distance cluster combine.The abscissa is the distance; The ordinate represents the order of keyword frequency.The color blocks labeled with serial numbers represent clusters: Ⅰindicates the occurrence and control of major insect and mite pests in cassava; Ⅱindicates the occurrence and control of cassava mosaic disease, Ⅲ indicates the occurrence and control of cassava bacterial blight, and Ⅳindicates cassava disease/pest resistance mechanisms. 图 3 我国木薯主要病虫害研究关键词系统聚类树状图 Fig. 3 Dendrogram of keywords on main diseases and pests of cassava in China |
第一类为木薯主要虫(螨)害的发生及防治研究(图 3,Ⅰ)。其聚类下的关键词包括朱砂叶螨、木薯单爪螨、抗性、抗螨、木瓜秀粉蚧、木薯品种、发育、繁殖、木薯种质等。高频关键词频次结果表明,朱砂叶螨、木薯单爪螨、二斑叶螨、木瓜秀粉蚧等是我国木薯虫(螨)害研究领域重点关注的对象。据相关资料描述,朱砂叶螨是一类发育迅速、繁殖力高、寄主范围广泛的害虫(螨),最初在海南、广西等木薯主产区分布[14],而后传播至广东、云南、福建、江西等地[15],成灾严重时可造成木薯50%—70%的减产,甚至绝收[16]。木薯单爪螨为一类重要的检疫性害螨,原产于南美洲,2008年首次在我国海南儋州发现,目前广泛分布于广东、广西、云南等地[17],成灾严重时可造成木薯40%—60%的减产[18]。二斑叶螨是我国木薯主栽区四大有害生物之一[19],为害后期导致叶片大面积褐化,甚至成焦枯状,是我国木薯产业可持续发展重要的限制因子之一。木瓜秀粉蚧为害的寄主植物超过90%来源于热带和亚热带[20],是世界范围内一类重要的检疫性有害生物,目前已在我国木薯主产区发现,为害日趋严重,已成为限制木薯产业可持续发展的限制因子之一。目前,在木薯主要虫(螨)害的发生及防治研究领域,国内取得的显著成果包括:一是鉴定了一批与木薯抗虫(螨)相关的基因,揭示了其在防御反应中的作用;二是初步阐明了木薯—害虫(螨)互作分子机理;三是揭示了害虫(螨)在不同环境条件下的生态适应性问题。
第二类为木薯花叶病发生及防治研究(图 3,Ⅱ)。其聚类下的关键词包括木薯花叶病、烟粉虱、非洲木薯花叶病毒(ACMV)、双生病毒、基因组、病情指数等。高频关键词结果表明,木薯花叶病(Cassava Mosaic Disease,CMD)是我国木薯病毒性病害研究领域重点关注的对象。木薯花叶病最开始在坦桑尼亚发现,侵染株系为非洲木薯花叶病毒,受感染的植株叶片呈扭曲或卷曲状,叶面发黄,表现出斑驳的马赛克图案。该病毒通过烟粉虱和带病毒的扦插经传播,广泛分布于亚洲、非洲和南美洲,在世界范围内造成作物大面积减产[1]。不同地区流行的病毒株系有所不同,在南亚地区,花叶病由印度木薯花叶病毒(ICMV)和斯里兰卡木薯花叶病毒(SLCMV)2个株系引起;在我国,造成花叶病的病原初步鉴定为斯里兰卡花叶病毒和木薯普通花叶病毒,且存在复合侵染的情况[21]。目前,在木薯花叶病研究领域,国内取得的主要成果包括:一是成功鉴定了国内木薯花叶病的主要病原,并初步建立了分子检测体系;二是建立了木薯花叶病的监测技术规程,规范了监测点的建设、病情调查方法、监测及数据统计等技术要点;三是对木薯花叶病病毒的致病分子机制进行了初步探索。
第三类为木薯细菌性枯萎病(Cassava bacterial wilt disease,CBB)发生及防治研究(图 3,Ⅲ)。其聚类下的关键词包括细菌性枯萎病、蛋白质互作、抗病性、转录因子和细菌性枯萎病菌等。高频关键词结果表明,木薯细菌性枯萎病是我国木薯细菌性病害研究领域重点关注的对象。木薯细菌性枯萎病由菜豆黄单胞菌木薯萎蔫致病变种(Xanthomonas phoseoli pv.manihotis,Xpm; 先前被称作Xanthomonas axonopodis pv.manihotis)侵染引起,为一种植物维管束病害[22]。受感染植株叶片萎蔫,有胶状物渗出,茎维管坏死,可造成木薯75%的减产[1]。该病在我国危害严重,调查表明,木薯细菌性枯萎病在我国海南、广西、广东、云南、江西等地发生,华南系列木薯品种受害程度显著,细菌性枯萎病菌经有害生物风险分析(PRA)模型评估为高度危险有害生物[23]。目前,在木薯细菌性枯萎病研究领域,国内取得的主要成果包括:一是成功构建了一定体量的木薯细菌性枯萎病菌转化子库,为病原菌致病基因功能的研究提供了基础;二是初步挖掘了木薯抗病基因网络并对其作用机制进行解析;三是初步筛选了一批抗木薯细菌性枯萎病的种质;四是建立了木薯细菌性枯萎病分子诊断技术;五是初步探索了针对木薯细菌性枯萎病的生物防治和化学防治方法。
第四类为木薯病虫害抗性机制研究(图 3,Ⅳ)。其聚类下的关键词包括生物学特性、木薯炭疽病,基因表达,抗、感木薯品种,二斑叶螨,木薯绵粉蚧,病毒诱导的基因沉默技术(Virus-induced Gene Silencing, VIGS)等。具体的研究方向涉及木薯白点病[24]、疫霉根腐病[25]、褐斑病[26]、棒孢霉叶斑病[27]、炭疽病[28]、离孺孢叶斑病[29]等病原的鉴定及防治技术;分析不同木薯品种对病虫害的抗性与感病性差异,以及基因表达在这些过程中的作用,识别抗病相关候选基因;运用病毒诱导的基因沉默技术解析木薯的抗病性机制,从而评估相关基因在抗病性中的功能和重要性。现有研究旨在增进木薯抗病虫害机制分子层面的理解,探索新的分子标记和基因资源,为培育具有更强抗性的木薯新品种提供理论基础和技术支持,为木薯的病虫害管理提供更为精准和有效的策略。
2.4 基于战略坐标的研究主题演化阶段分析战略坐标图是一种类团分析方法,以密度和向心度指标度量研究主题的位置坐标。密度用于度量类别之内主题词的紧密程度,向心度用于度量主题词与其他类别主题词之间的紧密程度,旨在分析某一研究领域内部及领域间相互影响的情况,揭示领域内研究的发展、演化趋势[30]。本研究以向心度为X轴,密度为Y轴,密度和向心度的均值为原点,对前述主题类团进行相关分析,结果如图 4所示。处于象限Ⅰ中的主题为木薯细菌性枯萎病发生及防治研究(类团Ⅲ)。该类团具有较高的密度和向心度,其发展阶段表现为核心、成熟,表明该研究主题为我国木薯病虫害领域重点关注的分支方向,相较于其他主题已有较为丰富的研究结果,为该领域关注的热点。处于象限Ⅱ中的主题为木薯主要虫(螨)害的发生及防治研究(类团Ⅰ)。该类团具有较高的密度和较低的向心度,其发展阶段表现为周边、成熟,表明该研究主题已经形成了一批规模性成果,但与其他主题联系不密切,表现为一定的独立性。处于象限Ⅲ的主题为木薯花叶病发生及防治(类团Ⅱ)。该类团密度和向心度都较低,其发展阶段表现为周边、不成熟,表明该研究主题目前获得的关注度较低,成果尚未具备规模性。处于象限Ⅳ的主题为木薯病虫害抗性机制(类团Ⅳ)。该类团具有较高的向心度和较低的密度,其发展阶段表现为核心、不成熟,表明该研究主题与其他研究主题联系密切,为学者重点关注的议题,但由于内部结构松散,具有演化成多个研究主题的潜力,为未来关注的趋势方向。
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| X-axis is the centripetal degree, which is used to reflect the connection strength between the classes.The larger the value is, the more central the development of the theme classes is.Y-axis is density, which is used to reflect the strength of interactions within the class cliques, with higher values representing more developed and mature within the subject cliques.Quadrant Ⅰrepresents the core development and maturity of the theme; Quadrant Ⅱ represents the periphery and maturity of the theme; Quadrant Ⅲ represents the peripheral and immature development of the theme; Quadrant Ⅳ represents the core and immature development of the theme. 图 4 我国木薯主要病虫害研究领域战略坐标 Fig. 4 Strategic coordinates of the main diseases and pests of cassava in China |
3 讨论
木薯作为热带及亚热带地区重要的经济作物,在食品加工、饲料生产和工业原料运用方面有重要的应用价值。然而,由于受各类病虫害的威胁,木薯生产中面临着种植成本增加、产量降低、品质下降、市场价值不稳定的风险。我国木薯栽植已有200多年历史,随着农业环境的变迁,主要病虫害的种类、为害程度及防治技术都在不断变更[4]。通过对我国木薯病虫害研究文献的梳理,发现目前我国报道的木薯病害包括白点病[24]、疫霉根腐病[25]、褐斑病[26]、棒孢霉叶斑病[27]、离孺孢叶斑病[29]、丛枝病[31]、蛙皮病[31]、细菌性枯萎病[32]、炭疽病[33]、藻斑病[34]、褐条病[35]、花叶病[36]等;木薯虫(螨)害包括木瓜秀粉蚧[20]、二斑叶螨[37]、朱砂叶螨[38]、单爪螨[39]、斜纹夜蛾[40]、木薯绵粉蚧[41]、红火蚁[42]、蔗根锯天牛[43]、蛴螬[43]、螺旋粉虱[44]等。值得注意的是,尽管木薯病虫害领域的研究对象多元,但是在研究规模、研究关注度及研究深度上有所区别。本研究基于共词分析理论[45],揭示了我国木薯病虫害研究水平及发展的动态结构。
3.1 木薯细菌性枯萎病发生及防治研究木薯细菌性拓萎病发生及防治是木薯病虫害领域的核心主题。分析显示,木薯细菌性枯萎病发生及防治研究在我国木薯病虫害领域中居核心且成熟的地位。一方面是由于该病自1980年在我国海南首次报道以来[46],其传播速度快和破坏性强,迅速被我国学者关注[47],整体研究历程长。另一方面,作为国际上重要的检疫性病害,该病导致木薯产量显著下降,其潜在的贸易影响受到国际上的重视。为此,国内学者就木薯细菌性枯萎病病原学鉴定与分析、植物与病原菌互作机理、抗病性评价及种质筛选、病害监测及防治技术等方面展开相关研究。在病原学鉴定与分析方面,祝天成等[48]利用随机扩增多态性DNA标记技术(RAPD)比较分析了木薯细菌性枯萎病病原菌菌株间的遗传差异,将国内采集的供试菌株划分为7个类群。Zhu等[49]通过测序,报告了Xpm CHN01的完整基因组序列。在植物与病原菌互作机理方面,黄贵修团队从病原菌致病型分化、病原菌致病基因功能鉴定等方面探索了木薯细菌性枯萎病病原菌致病机理,构建了总数为20 382个克隆的枯萎病菌转化子库,筛选出一批致病相关突变体[50],明确了hrpG、hrpX基因参与枯萎病病原菌致病的作用机理[51]。施海涛团队则在木薯抗枯萎病基因网络和分子机制解析方面展开研究,旨在挖掘抗病主效基因网络,促进抗病遗传品种改良,揭示了褪黑素合成基因转录激活因子MeRAV1、MeRAV2[52],碱性亮氨酸拉链转录因子MebZIP3、MebZIP5[53],GAPDH家族成员MeGAPCs[54],热激蛋白HSP90[55],MeWRKY75-MeWHY3转录模块[56]等在木薯抗细菌性枯萎病分子机制上的作用。在抗病性评价及种质筛选方面,卢昕等[57]对国内603份木薯种质开展了木薯细菌性枯萎病人工抗性评价,筛选出高抗种质6份,抗性种质87份。徐春华等[58]评价了42份木薯种质的抗病情况,发现TCGRI005等4份种质对木薯细菌性萎蔫病表现中抗。在病害监测及防治技术方面,封立平等[59-60]建立了从木薯繁殖材料进行病原菌检验的PCR检测和环介导等温扩增技术(LAMP)高通量检测方法。徐春华等[61]从防治药剂筛选、施药技术优化等方面深化对木薯细菌性萎蔫病控制技术的探索,发现乙蒜素和硫酸链霉素对该病菌具有明显的抑制效果,田间试验显示无人机喷洒乙蒜素有利于木薯细菌性枯萎病流行时的应急防治[62]。郑丽等[63]开展了木薯细菌性枯萎病的生防菌株筛选和防效探究,发现短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)可作为抗木薯细菌性枯萎病的生防菌株。这些成果不仅深化了对木薯与木薯细菌性枯萎病菌互作机制的理解,而且为开发新型抗病品种提供了重要的理论依据和技术支持,也为其他作物的病害防治研究提供了有益的参考。
3.2 木薯虫(螨)害发生及防治研究木薯虫(螨)害发生及防治研究是木薯病虫害领域的专化主题。分析显示,木薯虫(螨)害发生及防治研究在该领域中居成熟但周边的地位。这是由于所研究的虫(螨)害多样性高,且它们为害植物时通常缺乏专一性。因此,当分析对象仅限于木薯时,该主题的数据结果便呈现出较低的向心度。另一层面上,也因为我国木薯种植业虫(螨)害发生范围日趋扩大,为害程度愈发严重,检疫性有害生物传入后扩散成灾风险增高,故国内学者对其一直保持关注,并形成一定的研究规模。目前,国内研究重点从害虫(螨)的寄主选择性、生态适应性、扩张机制、有害防治、抗性评价与种质筛选等方面展开。以近5年来关注热度较高的木瓜秀粉蚧为例,陈青团队从取食植物后害虫(螨)发育和繁殖能力变化[64]、有害生物自身保护酶基因表达差异分析[65-66]、植物次生代谢物防御[67]、植物营养物质变化防御[68]等方面逐步探明木瓜秀粉蚧与木薯的互作机制。在木薯二斑叶螨的防治方面,该团队一方面从作物抗虫机理角度出发,对调控作物黄酮类代谢物质关键基因[37]、木质素合成关键基因[69]、生氰糖苷降解途径关键基因[70]、茉莉酸信号途径表达基因[71]等进行了探究;另一方面开展了抗二斑叶螨木薯品种鉴定与评价[72],为木薯抗螨种质的创制与分子设计育种提供理论依据与策略。此外,该团队还基于绿色防控视角,开展了甜玉米与木薯间套作对二斑叶螨的防控研究[19],为有效阻截二斑叶螨的扩张侵害和进一步制定绿色防控策略提供指导。相关成果增进了对木薯-害虫(螨)互作机制的理解,一方面为害虫(螨)监测和防控策略提供技术支持,另一方面为木薯抗虫(螨)害分子育种提供理论参考。
3.3 木薯花叶病的发生及防治研究木薯花叶病的发生及防治研究是木薯病虫害领域的边缘主题。分析显示,木薯花叶病的发生及防治研究在该领域中居不成熟且周边的地位。主要原因是我国木薯花叶病发现时间较晚,2018年才被首次发现[36],整体研究处于初级阶段,尚未形成规模。目前,国内学者对木薯花叶病的研究涵盖了病原分离与鉴定、病害调查与监测、病媒(烟粉虱)传播机制分析和病毒致病机理解析等诸多方面。经初步鉴定,我国目前造成花叶病的病原为SLCMV和CsCMV[21, 73],在此基础上,我国木薯花叶病分布及危害情况调查研究逐步开展,如段春芳等[74]调查怒江干热河谷木薯花叶病发生情况,发现其病媒烟粉虱种群数量的高峰期在8—9月,2019—2020年间,分别有42份和18份种质发生花叶病,木薯主推品种均不抗病,主要流行原因为种茎带毒。饶萍等[75]对贵州望谟的木薯种质资源圃花叶病发生情况展开调查,植株发病高峰和烟粉虱种群数量高峰分别集中于7月和9月,发病率、烟粉虱种群数量均与温度存在相关性,表现为随温度降低而降低。了解木薯花叶病的致病机制,是开展花叶病防控的重要前提,国内学者针对SLCMV和CsCMV的致病机理展开了初步探索。Wang等[76]对中国发现的SLCMV-Col和SLCMV-HN7病毒株进行比较基因组分析,发现位于复制蛋白(Replication protein,Rep)C端的7个氨基酸模体对Rep蛋白在植物中的积累和增强病毒毒力有着重要的作用,并证实了SA信号通路在植物响应该病毒入侵过程的作用。Wei等[77]发现外壳蛋白(Coat Protein,CP)是CsCMV侵染的关键蛋白,并通过与木薯靶标RAV1/2转录因子互作来介导病毒与木薯之间的攻防机制。在病媒传播机制的研究上,Chi等[78]发现Asia Ⅱ 1型烟粉虱可以有效传播SLCMV,且不同类型的烟粉虱对病毒传播存在差异,传播效率与烟粉虱上携带的病毒量呈正相关。木薯花叶病的防控目前仍主要依赖检疫措施,因此,开发高效的病原快速检测技术是疫情监测与防控的关键。为此,Wang等[79]建立了一种整合分子检测与酶联免疫吸附试验(ELISA)的改进型CMV检测系统,为我国及全球木薯花叶病的系统性防控提供了重要技术支撑。
3.4 木薯病虫害抗性机制研究木薯病虫害抗性机制研究是木薯病虫害领域的基础和新兴主题。分析显示,木薯病虫害抗性机制研究在该领域中居不成熟但核心的地位。直观反映我国目前在木薯病虫害互作分子机制研究方面尚未广泛展开,病原物毒性遗传学与木薯抗性遗传学理论还有待充实。我国虽然已经建立了较为完整的病虫害监测、病原学分析、病原与作物互作机理研究、抗病虫种质的筛选及防治控制技术研发的技术体系,但目前仍然存在较大纵深探索的空间。在病原与作物互作机理研究方面,现有研究多从单基因功能研究、转录组水平来进行阐述,缺乏对基因—蛋白—代谢物跨层级关联分析与调控网络构建的深入探讨。在抗病虫种质的筛选方面,还需要进一步开展人工接种和田间抗病性评价的一致性检验。在病虫害防控关键技术的研发方面,仍需进一步开发绿色高效的防治制剂以及基于田间环境的高效施药技术。
综上,我国木薯病虫害研究未来将始终围绕“病虫害为害生物学特性—病虫害发生规律—病原与作物互作机制—病虫害防控策略”这一主线展开。基于此,我们认为未来可以继续深化的研究方向包括:一是病虫害抗性机制的分子解析,利用基因组学、转录组学、蛋白组学等多组学技术揭示木薯对病虫害的抗性机制,识别关键抗性基因和信号通路,为抗性育种提供分子标记和基因资源;二是病虫害绿色防控策略的开发与优化,基于病虫害生物学特性和抗性机制的研究,开发和优化绿色防控策略,减少化学农药的使用,提高木薯产业的可持续性;三是木薯病虫害数据资源平台的构建,建立木薯病虫害的数据库和信息平台,整合病虫害生物学、遗传学、生态学和防控策略等多维度数据,为木薯病虫害研究和防控提供信息支撑。
4 结论本研究基于我国木薯病虫害研究领域文献数据,依据文献年度增长规律,划分文献的发展阶段;通过研究力量布局分析,揭示了领域研究的执行高地和交流的主要阵地;通过构建共词矩阵和系统聚类,明确领域具体的研究主题,进一步地,借助战略坐标分析,明晰了研究领域内关注的核心主题。其研究结论如下。
一是关注度持续提升。我国木薯病虫害研究领域文献增长历经了初始期(1981—2002年)、发展期(2003—2016年)和快速发展期(2017年至今)3个阶段,中文文献和外文文献显著增长的拐点分别为2010年和2017年,整体呈稳步增长的趋势。
二是研究执行高地和交流阵地已初步形成。中国热带农业科学院、海南大学为该领域的主要研究机构;陈青、黄贵修、施海涛、陈银华、刘光华等为该领域作者合作网络中的核心作者。中文文献载文量最多的刊物为《热带作物学报》,外文文献载文量最多的刊物为Frontiers in Plant Science。
三是领域内研究主题侧重明显,发展成熟度各不相同。我国木薯病虫害研究主要分为木薯主要虫(螨)害的发生及防治研究、木薯花叶病发生及防治研究、木薯细菌性枯萎病发生及防治研究、木薯病虫害抗性机制研究4个类别。重点关注的研究对象包括木薯细菌性枯萎病、木薯花叶病、木薯炭疽病、木薯褐斑病、朱砂叶螨、木薯单爪螨、二斑叶螨、木瓜秀粉蚧、烟粉虱、木薯绵粉蚧等。其中,木薯细菌性枯萎病的发生及防治研究主题居核心地位,并且形成了涵盖枯萎病病原学鉴定与分析、植物与病原菌互作机理,以及病害监测及防治技术的研究体系。近年来的研究热点集中于解析木薯抗枯萎病基因网络和分子机制方面,为促进木薯抗病遗传品种改良提供了相关理论依据。
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