深海真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021的次级代谢产物研究
罗琴琴1, 陈子明1, 曾金凤2, 曾玲1, 郑翠平2, 陆根兰2, 王锂韫2, 孙玉林2     
1. 岭南师范学院化学化工学院, 广东湛江 524048;
2. 岭南师范学院生命科学与技术学院, 广东湛江 524048
摘要: 通过多种现代化波谱手段,对深海真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021的次级代谢产物进行挖掘。采用硅胶柱层析、Sephadex LH-20凝胶柱层析和高效液相色谱等分离技术,对该菌株发酵产物中的化学成分进行研究,并运用核磁共振(NMR)、质谱(MS)和文献比对鉴定其化学结构。结果显示:从该菌株的发酵产物中共分离得到5个单体化合物,分别为1,3-dimethyluracil(1)、[2E,7E]-9-oxo-2,7-decadienoic acid(2)、periconianones H(3)、botryosphaeridione(4)和2-hydroxy-(4-octyloxy)benzophenone(5),化合物1-5均是首次从该菌株中分离得到。化合物3对5株肿瘤细胞株HepG-2、Eca109、KG-1a、PC-3和Hep2均未显示出细胞毒活性,仅对Hela显示弱的抑制活性。实验结果不仅丰富了该菌属的化学成分类型,而且也增强了深海真菌的研究价值。
关键词: 深海真菌    Trichobotrys effuse DFFSCS021    次级代谢    结构鉴定    细胞毒活性    
Studies on the Secondary Metabolites of Deep-sea-derived Fungus Trichobotrys effuse DFFSCS021
LUO Qinqin1, CHEN Ziming1, ZENG Jinfeng2, ZENG Ling1, ZHENG Cuiping2, LU Genlan2, WANG Liyun2, SUN Yulin2     
1. School of Chemistry and Chemical Engineering, Lingnan Normal University, Zhanjiang, Guangdong, 524048, China;
2. School of Life Science and Technology, Lingnan Normal University, Zhanjiang, Guangdong, 524048, China
Abstract: Through a variety of modern spectrum methods, the secondary metabolites of a deep-sea-derived fungus Trichobotrys effuse DFFSCS021 were excavated.The chemical components of the fermentation products of this strain were isolated and purified by silica gel, Sephadex LH-20, and semi-preparative reverse-phase HPLC (C18) and other separation techniques.Its chemical structure was identified by nuclear magnetic resonance (NMR), mass spectrometry (MS) and literature comparison.The results showed that a total of 5 monomer compounds were isolated from the fermentation product of the strain and their structures were identified as 1, 3-dimethyluracil (1), [2E, 7E]-9-oxo-2, 7-decadienoic acid (2), periconianones H (3), botryosphaeridione (4) and 2-hydroxy-(4-octyloxy)benzophenone (5).The compounds 1-5 were all isolated from this strain for the first time.The experimental results not only enriched the types of chemical components of the genus, but also improved the research value of the deep-sea-derived fungus.
Key words: deep-sea-derived fungus    Trichobotrys effuse DFFSCS021    secondary metabolites    structure identification    cytotoxic activity    
0 引言

深海微生物对深海特殊生境(高盐、高压、低温、寡营养等)的适应,造就了其区别于陆生微生物的生物合成途径和酶促反应体系,因而具备产生具有新颖化学结构和独特生物活性代谢产物的能力,是开发天然活性药物先导化合物的资源宝库[1]。据统计,2017年被报道的来自微生物的海洋天然产物占总报道化合物的57%[2]。2018年,张长生等[3]着眼于生态环境、物种多样性和应用领域等方面,指出海洋微生物的研究是一个充满着机遇和挑战的领域。真菌是海洋微生物中重要的类群之一,其代谢产物丰富,且具有新奇的化学结构以及显著的生物活性[4],具有巨大的发展潜力。2017年,高啸巍等[5]对深海真菌Acaromyces ingoldii FS121次级代谢产物进行分离得到化合物22-四烯-3-酮,该化合物在100 μg/mL浓度下,对SF-268、MCF-7、NCI-H460和HepG-2这4种肿瘤细胞株表现出显著的增殖抑制活性, 其半数抑制率IC50值分别为5.3,6.5,12.2和6.1 μmol/L。2018年,马新华等[6]对南海深海沉积物来源真菌Aspergillus sp.MCCC3A400414次级代谢产物的化学成分和生物活性进行研究,从中分离得到5个化合物,即(22E, 24R)-麦角甾-5, 7, 22-三烯-3β-醇、WIN 64821、diorcinol、9-十八碳烯酸和9, 12-十八碳二烯酸。WIN 64821对肿瘤细胞株PANC-1、MCF-7、HepG-2和A549表现出中等强度的细胞毒活性,其IC50值在7.14—15.78 μmol/L[6]。2019年,陈闪冲等[7]从深海真菌Phomopsis tersa的次级代谢产物中分离得到5α,8α-表二氧麦角甾-6, 22-二烯-3β-醇和麦角甾醇,这2个化合物对SF-268、MCF-7、HepG-2和A549 4种肿瘤细胞株具有一定的细胞毒活性。

虽然深海真菌的次级代谢产物结构丰富、活性广泛,但开发程度较低,仍存在较大的挖掘空间。真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021分离自我国南海北部2 403 m深的海底沉积物中,纯菌株菌落呈绒状,展开,有凹沟,直径2—3 cm,中央淡粉色周围白色,中间有小气孔。2016年,Sun等[8]从该菌中分离得到3个新的大环内酯类化合物trichobotryside A、trichobotrysides B-C,其中trichobotryside A具有较强的抗生物污损活性,对草苔虫和藤壶幼虫的半数最大效应浓度(EC50)值分别为7.3和2.5 μg/mL。为进一步发掘结构新颖、活性显著的新型化合物,本实验对真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021的次级代谢产物进行研究,以期丰富其次级代谢产物的结构类型,为海洋药物先导化合物的开发与利用提供物质基础。

1 材料与方法 1.1 仪器与材料

Bruker Avance DRX-500MHz型超导核磁共振仪(内标为TMS:德国布鲁克仪器有限公司)、N-1210B型(EYELA)旋转蒸发仪(上海爱郎仪器有限公司)、LC-20AD型高效液相色谱仪(岛津企业管理(中国)有限公司)、YMC-PACKODS-A型分析色谱柱(规格:150×4.6 mml.D.S - 5 μm,12 nm)、YMC-PACKODS-A型半制备色谱柱(规格:250×10 mml.D.S-5 μm,12 nm),Bruker microTOF-QⅡ高分辨电喷雾质谱仪(HR-ESI-MS)、Bruker amaZonSL低分辨电喷雾质谱仪(ESI-MS)(布鲁克(北京)科技有限公司),iMark酶标仪(美国BIO-RAD公司)、MCO-175型CO2培养箱(日本Sanyo公司)、SW-CJ-2FD型超净工作台(苏州净化设备公司)、ZF-7型三用紫外分析仪(上海顾村电光仪器厂)、CCA-1112A型冷却水循环装置(上海爱郎仪器有限公司)、SB-800DT型超声波清洗器(宁波新芝生物科技股份有限公司)、Direct-Q5UV-R型超纯水一体机(默克密理博(上海)实验设备科技有限公司)、JJ-2型组织匀浆机(常州澳华仪器有限公司),所用试剂均为分析纯。

深海真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021,采自南海北部(112°30.203′E, 18°1.654′N) 2 403 m深的海底沉积物中,经分离培养纯化后得到纯菌株保藏于中国科学院海洋微生物中心。

1.2 方法 1.2.1 菌株鉴定

深海真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021的总DNA按照文献[9]方法提取,设计引物对总DNA中的ITS序列进行PCR扩增,回收纯化扩增产物并连接到PCR21载体(Invitrogen)中。16S rRNA基因序列送生工生物工程(上海)股份有限公司测定,将测得的16S rRNA基因序列进行BLAST分析,发现其与T.effusa isolate 1179 (accession No.KJ630313)相似度为99%。

1.2.2 菌株的发酵培养

从PDA固体培养基平板上,用接种环刮取2环该菌株的孢子, 接种于盛有PDA液体培养基的三角锥形瓶中,置于摇床上180 r/min、28℃恒温培养3—7 d,待三角锥形瓶中菌丝体生长成球形黄豆粒大小时,将生长好的种子液接种到含80 g大米培养基的1 L三角瓶中,每瓶接种10 mL,共接种50瓶,28℃静置30 d。

PDA液体培养基:马铃薯200 g,葡萄糖20 g,海盐36 g,蒸馏水溶解定容至1 000 mL。固体培养基在此基础上添加20 g琼脂。

大米培养基:大米80 g,酵母膏0.4 g,葡萄糖0.4 g,海盐3.6 g,蒸馏水溶解定容至120 mL。

1.2.3 高效液相色谱(HPLC)分析及半制备

分析条件:流速为1 mL/min,流动相为MeOH/H2O体系,检测波长为210,254,280,360 nm,柱温箱温度为35℃,进样量为5 μL。半制备条件:流速为3 mL/min,流动相为MeOH/H2O体系,检测波长为210,254,280,360 nm,柱温箱温度为35℃,进样量为60 μL。分析时根据化合物的极性来调整MeOH/H2O的比例,以达到半制备的目的。

1.2.4 发酵产物的提取与分离

将发酵好的大米培养基用80%丙酮-水浸泡,接着用组织匀浆机破壁,之后超声30 min,用布氏漏斗抽滤,旋转蒸发除去丙酮,将剩下的水相再用乙酸乙酯进行萃取(V乙酸乙酯:V=2:1),静置分层,取上层乙酸乙酯相进行浓缩称量,共得到浸膏30 g。

将乙酸乙酯萃取的浸膏30 g经硅胶(100—200目)柱层析,以氯仿/甲醇(体积比1:0—0:1)进行梯度洗脱,最后合并为7个流分(Fr 01—Fr 07)。

流分Fr 05 (4 g)经硅胶(200—300目)柱层析,以氯仿/甲醇(体积比20:1—1:1)梯度进行洗脱,得到4个亚流分(Fr 0501—Fr 0504),亚流分Fr 0502 (280 mg)经Sephadex LH-20凝胶柱层析得到4个亚流分(Fr 050201—Fr 050204),亚流分Fr 050204(80 mg)经半制备HPLC进一步纯化得到化合物1 (V甲醇:V=10:90,tR= 20.5 min,26 mg)。

流分Fr 03 (7.5 g)经硅胶(200—300目)柱层析,以氯仿/丙酮(体积比50:1—0:1)梯度进行洗脱,得到4个亚流分(Fr 0301—Fr 0304),亚流分Fr 0302 (1 g)经Sephadex LH-20凝胶柱层析得到4个亚流分(Fr 030201—Fr 030204),亚流分Fr 030201 (65 mg)经硅胶(200—300目)柱层析,以氯仿/丙酮(体积比20:1)等度进行洗脱,得到化合物2 (13.5 mg)。

流分Fr 04 (0.7 g)经硅胶(200—300目)柱层析,以氯仿/甲醇(体积比20:1—0:1)梯度进行洗脱,得到4个亚流分(Fr 0401—Fr 0404),亚流分Fr 0401 (244.1 mg)经Sephadex LH-20凝胶柱层析得到3个亚流分(Fr 040101—Fr 040103),亚流分Fr 040103 (45.5 mg)经半制备HPLC进一步纯化得到化合物4 (V甲醇:V=35:75),tR=30.5 min,4.9 mg)。亚流分Fr 0402 (122.6 mg)经半制备HPLC进一步纯化得到化合物3 (V甲醇:V=33:77,tR=28 min,15 mg)。

流分Fr 02 (0.52 g)经硅胶(200—300目)柱层析,以石油醚/氯仿(体积比50:1—0:1)梯度进行洗脱,得到3个亚流分(Fr 0201—Fr 0203),亚流分Fr 0201 (175.9 mg)经半制备HPLC进一步纯化得到化合物5 (V甲醇:V=85:15,tR=44 min,3.1 mg)。

1.2.5 细胞毒活性测定

参照文献[10]的方法,取对数生长期的肿瘤细胞,将细胞密度调至2×105个/mL,按每孔200 μL加到96孔细胞培养板中,放入37℃培养箱中并通入体积分数5% CO2,培养4 h。化合物样品分别设定5个浓度梯度,每个浓度设3个重复,同时设阳性、阴性对照,每孔肿瘤细胞中分别加样品液或空白液2 μL,再培养72 h。然后每孔加四甲基偶氮唑蓝(MTT)液10 μL,继续培养4 h,在37℃、2 000 r/min条件下,离心8 min,吸去上清液。每孔分别加入二甲基亚砜(DMSO)100 μL,在微量振荡器上振荡15 min,至结晶完全溶解后,用酶标仪测定每孔在570 nm处的吸光值(OD值)。取3孔平均OD值,按对细胞增殖的抑制率(IR,%)=[(OD空白-OD样品)/OD空白]×100%, 计算样品IR,并采用bliss法计算出半数抑制率IC50

2 结果与分析 2.1 化合物结构鉴定

化合物1—5的结构如图 1所示。

图 1 化合物15的结构 Fig. 1 Structures of compounds 15

化合物1:白色无定形粉末。1H NMR(500 MHz, CDCl3) δH 7.12(1H, d, J= 7.5 Hz, H-6), 5.74(1H, d, J=7.5 Hz, H-5), 3.80(3H, m, 1-NCH3), 3.35(3H, m, 3-NCH3)。13C NMR(125 MHz, CDCl3)δ:162.3(s, C-4), 151.4(s, C-2), 144.6(d, J=5.5 Hz, C-6), 102.4(d, J=5.5 Hz, C-5), 36.7(s, 3H), 28.2(s, 3H)。低分辨质谱(+)-ESIMS给出准分子离子峰m/z 141.1[M+H]+和281.1[2M+H]+,(-)-ESIMS给出准分子离子峰m/z 139.3 [M-H]-。上述氢谱和质谱数据与文献报道的数据[11]一致,故鉴定该化合物为1, 3-dimethyluracil。

化合物2:无色油状物。1H NMR (500 MHz, CDCl3) δH 7.05(1H, dd, J1=7.0 Hz, J2=15.5 Hz, H-3), 6.78(1H, dd, J1=6.5 Hz, J2=16.0 Hz, H-7), 6.09(1H, d, J=16.0 Hz, H-8), 5.85(1H, d, J=15.5 Hz, H-2), 2.29(2H, m, H-4), 2.28(2H, m, H-6), 2.26(3H, s, H-10), 1.67(2H, m, H-5);13C NMR(125 MHz, CDCl3)δC198.5(C, C-9), 170.6(C, C-1), 150.8(CH, C-3), 146.9(CH, C-7), 131.8(CH, C-8), 121.2(CH, C-2), 31.7(CH2, C-4), 31.6(CH2, C-6), 21.7(CH3, C-10), 26.3(CH2, C-5)。(+) -HRESIMS给出的分子式为C10H15O3(m/z 183.101 5 [M+H]+,calcd.for C10H15O3, 183.101 6)。上述数据与文献[12]一致,故鉴定该化合物为[2E, 7E]-9-oxo-2, 7-decadienoic acid。

化合物3:无色粉末。1H NMR (500 MHz, CDCl3) δH 6.88(1H, d, J=10.0 Hz, H-1), 5.80(1H, s, H-9), 5.93(1H, d, J=10.0 Hz, H-2), 4.24 (1H, d, J=7.0 Hz, H-8), 3.87(1H, m, H-7), 2.45(1H, dd, J1=6.5 Hz, J2=13.5 Hz, H-4), 1.97(1H, dd, J1=2.5 Hz, J2=12.5 Hz, H-6a), 1.65(1H, t, J=12.5 Hz, H-6b), 1.07(3H, s, H-12), 1.06(3H, s, H-11);13C NMR (125 MHz, CDCl3)δC200.8(C, C-3), 143.8(CH, C-1), 142.1(C, C-10), 131.8(CH, C-9), 127.2(CH, C-2), 74.4(CH, C-8), 70.0(CH, C-7), 53.2(CH, C-4), 42.0(CH2, C-6), 41.2(C, C-5), 20.1(CH3, C-12), 7.2(CH3, C-11)。(+) -HRESIMS给出的分子式为C12H17O3 (m/z 209.078 7 [M+H]+,calcd.for C12H17O3, 209.078 1)。上述数据与文献[13]报道一致,故鉴定该化合物为periconianones H。

化合物4:无色粉末。1H NMR(500 MHz, CDCl3) δH 7.21(1H, d, J=10.0 Hz, H-9), 6.30(1H, d, J=10.0 Hz, H-8), 6.53(1H, s, H-1), 6.38(1H, s, H-4), 2.53(1H, dd, J1=7.0 Hz, J2=13.5 Hz, H-6), 1.25(3H, s, H-11), 1.31(3H, d, J=7.0 Hz, H-12);13C NMR(125 MHz, CDCl3)δC198.6(C, C-7), 181.1(C, C-2), 160.8(C, C-10), 147.3(C, C-3), 141.6(CH, C-9), 131.8(CH, C-8), 125.9(CH, C-1), 123.1(CH, C-4), 50.9(CH, C-6), 45.2(C, C-5), 23.4(CH3, C-11), 8.2(CH3, C-12)。(+) -HRESIMS给出的分子式为C12H13O3(m/z 205.086 0 [M+H]+,calcd.for C12H13O3, 205.085 9)。上述数据与文献[14]报道一致,故鉴定该化合物为botryosphaeridione。

化合物5:无色油状物。1H NMR(500 MHz, CDCl3) δH 7.48(1H, m, H-6), 7.56(1H, m, H-4′), 7.63(2H, m, H-6′, H-2′), 7.49(2H, m, H-5′, H-3′), 6.40(1H, dd, J1=2.5 Hz, J2=9.0 Hz, H-5), 6.50(1H, d, J=2.5 Hz, H-3), 4.02(2H, m, H-8), 1.30(2H, m, H-13), 1.26(2H, m, H-11), 1.33(2H, m, H-12), 1.80(2H, m, H-9), 1.46(2H, m, H-10), 1.28(2H, m, H-14), 0.89(3H, s, H-15);13C NMR(125 MHz, CDCl3)δC200.1(C, C-7), 166.3(C, C-2), 165.8(C, C-4), 138.3(C, C-1′), 135.2(CH, C-6), 131.4 (CH, C-4′), 128.9(CH, C-6′, C-2′), 128.3(CH, C-5′, C-3′), 113.0(C, C-1), 107.8(CH, C-5), 101.5(CH, C-3), 68.5(CH2, C-8), 31.8(CH2, C-13), 29.3(CH2, C-11), 29.2(CH2, C-12), 28.9(CH2, C-9), 26.0(CH2, C-10), 22.7(CH2, C-14), 11.4(CH3, C-15)。(+) -HRESIMS给出的分子式为C21H27O3 (m/z 327.196 1 [M+H]+,calcd.for C21H27O3, 327.195 5)。上述数据与文献[15]报道一致,故鉴定该化合物为2-hydroxy-(4-octyloxy)benzophenone。

2.2 化合物活性测定

化合物3对人肝癌细胞(HepG-2)、人食管癌细胞(Eca109)、人急性骨髓白血病细胞(KG-1a)、人前列腺癌细胞(PC-3)和人喉癌细胞(Hep2)均未显示出细胞毒活性,仅对人宫颈癌细胞(Hela)显示出弱的抑制活性,其IC50值为20.5 μmol/L (表 1)。该结果与文献[13]报道的化合物periconianones H对Hela显示出弱的细胞毒活性(IC50=16.5 μmol/L)的结果较为一致。

表 1 化合物3的细胞毒活性测试结果 Table 1 Cytotoxicity test results of compound 3
化合物
Compound
细胞毒活性IC50Cytotoxic activity IC50 (μmol/L)
HepG-2 Hela Eca109 KG-1a PC-3 Hep2
3 > 100 20.5±2.15 > 100 > 100 > 100 > 100
Periconianones H[13] - 16.5 - - - -
阿霉素Doxorubicin 3.34±0.96 0.85±0.00 0.23±0.00 0.72±0.00 1.60±0.16 0.02±0.00
注:“—”代表未检出
Note:“—” represents undetectable

3 结论

本研究对来源于南海北部2 403 m深的海底沉积物中1株真菌Trichobotrys effuse DFFSCS021的乙酸乙酯萃取物进行化学成分研究,从中获得5个单体化合物,分别为1, 3-dimethyluracil (1)、[2E, 7E]-9-oxo-2, 7-decadienoic acid (2)、periconianones H (3)、botryosphaeridione (4)和2-hydroxy-(4-octyloxy) benzophenone (5),均为首次从该菌株中分离得到。对化合物3进行细胞毒活性筛选,结果表明该化合物对5株肿瘤细胞株HepG-2、Eca109、KG-1a、PC-3和Hep2均未显示出细胞毒活性,仅对Hela显示弱的抑制活性。另外,据报道,化合物4对双子叶植物莴苣的种子萌发具有显著的抑制活性[14],化合物25的活性数据未见报道。接下来将对剩余的4个化合物进行多种生物活性筛选,例如抑制种子萌发、抗菌以及抗生物污损等,以期为进一步研究该菌属的海洋真菌提供活性数据和参考资料。

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