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<title cf:type="text"><![CDATA[广西科学 -->濒危植物遗传多样性]]></title>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于EST-SSR分子标记的广西海伦兜兰遗传多样性研究]]></title>
<link><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230604&flag=1]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[海伦兜兰（<i>Paphiopedilum helenae</i>）具有极高的观赏价值，为国家一级重点保护野生植物。本研究利用EST-SSR分子标记技术对广西海伦兜兰的5个居群（71个样品）的遗传多样性和遗传结构进行分析，旨在为该种质资源的有效保护与利用提供参考依据。结果表明：海伦兜兰具有中等遗传多样性，多态位点百分比（PPB）为90%-100%，期望杂合度（<i>H</i><sub>e</sub>）平均值为0.451，香农信息指数（<i>I</i>）平均值为0.801。海伦兜兰绝大多数（93%）遗传变异存在于居群内，仅有7%遗传变异存在于居群间，居群内的遗传变异大于居群间的变异，基因流（<i>N</i><sub>m</sub>）平均值为4.916。非加权组平均法（UPGMA）、主坐标分析（PCoA）和Structure分析结果表明，聚类并未严格按照地理位置划分，广西邦亮长臂猿国家级自然保护区靖西市（JX）和龙州县下冻镇春秀村（LZ）居群的遗传多样性较高，应作为海伦兜兰重点保护单元进行保护。]]></description>
<pubDate>2024/2/26 17:40:35</pubDate>
<category><![CDATA[濒危植物遗传多样性]]></category>
<author><![CDATA[朱舒靖，邹蓉，柴胜丰，唐健民，唐凤鸾，陈泰国，韦霄]]></author>
<guid><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230604&flag=1]]></guid><cfi:id>5</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[基于SSR的广西同色兜兰和带叶兜兰遗传多样性分析]]></title>
<link><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230605&flag=1]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[评估四季开花型同色兜兰（<i>Paphiopedilum concolor</i>）和春季开花型带叶兜兰（<i>P.hirsutissimum</i>）的遗传多样性和种群结构，探究不同开花习性兜兰属物种间的遗传分化，为兜兰的可持续利用和野生资源保护提供理论依据。本研究利用10个多态性EST-SSR位点对12个同色兜兰和带叶兜兰种群的231个个体分型，开展遗传多样性、瓶颈效应、系统发育、遗传结构、遗传分化、距离隔离和环境隔离分析。结果表明，同色兜兰种群的大多数遗传多样性指标都显著（<i>P</i><0.05）低于带叶兜兰；分子方差分析（AMOVA）结果显示，两者来自种群间的变异都较少，且带叶兜兰来自个体内的遗传变异高于同色兜兰。在同色兜兰的两个种群中检测到显著（<i>P</i><0.05）瓶颈效应，而在带叶兜兰全部种群中均未检测到。群体水平的非加权平均（UPGMA）树和个体水平的邻接（NJ）树均显示同色兜兰和带叶兜兰间系统发育关系相对较近，并各自聚为一支。主坐标分析（PCoA）和Structure分析结果均支持系统发育分析结果。此外，遗传分化系数（<i>F</i><sub>ST</sub>）证实两个物种间的种群分化已达到较高水平。狭窄的自然分布和过去的种群瓶颈可能导致了同色兜兰的部分遗传多样性丧失。地理隔离是驱动同色兜兰和带叶兜兰种群遗传分化的主要因素，而环境隔离的作用较小。]]></description>
<pubDate>2024/2/26 17:40:35</pubDate>
<category><![CDATA[濒危植物遗传多样性]]></category>
<author><![CDATA[朱显亮，朱舒靖，邹蓉，唐健民，罗亚进，韦霄]]></author>
<guid><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230605&flag=1]]></guid><cfi:id>4</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[厚叶木莲(<i>Manglietia pachyphylla</i>)基因组草图]]></title>
<link><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230606&flag=1]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[厚叶木莲（<i>Manglietia pachyphylla</i>）为木兰科（Magnoliaceae）木莲属（<i>Manglietia</i>）的木本植物，零星分布于我国广东省和广西壮族自治区，为国家二级重点保护野生植物。了解濒危物种基因组信息及其遗传多样性有助于合理地保护和利用濒危物种，实现濒危物种的解濒和复壮。为此，本研究通过高通量测序方法对厚叶木莲基因组进行测序，并利用测序数据开展厚叶木莲基因组草图的组装；之后，基于组装的基因组预测其中的重复序列和基因，进行系统发育和基因家族分析。结果表明，组装的厚叶木莲基因组大小为2 092 298 891 bp，包含676个组装序列，N50（将组装的序列按照长度由大到小进行累加，当累加到某个序列时，累加的值为基因组50%的长度时，此序列的长度即为N50）为7 961 115 bp；利用BUSCO （Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs），针对“eudicots”和“embryophyta”这两个BUSCO单拷贝基因库，对基因组组装的完整性进行评估，组装的厚叶木莲基因组完整性分别为96.6%和98.8%。厚叶木莲基因组有76.5%的序列为重复序列，共有37 900个基因，这些基因编码了41 675个蛋白质序列。系统发育分析发现厚叶木莲与望春玉兰（<i>Magnolia biondii</i>）聚在一起，两者分化时间大致为10 500 000年前。厚叶木莲中与木质部/韧皮部、肌动蛋白丝、热、光合作用以及多种次生代谢相关的基因家族显著扩张，其中次生代谢相关基因在厚叶木莲基因组上呈串联和近端重复，这些基因的扩张和重复形成方式可能与厚叶木莲适应高海拔环境有关。本研究是国内外木兰科木莲属首个基因组报道，为更好地保护和开发厚叶木莲及木兰科其他物种的种质资源提供了遗传信息和参考。]]></description>
<pubDate>2024/2/26 0:00:00</pubDate>
<category><![CDATA[濒危植物遗传多样性]]></category>
<author><![CDATA[甘新军，宾粤，陈焕锦，朱韦光，熊露桥，余恩萍，王峥峰，徐凤霞，曹洪麟]]></author>
<guid><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230606&flag=1]]></guid><cfi:id>3</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[濒危植物合柱金莲木开花结实物候及交配系统研究]]></title>
<link><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230607&flag=1]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[合柱金莲木（<i>Sauvagesia rhodoleuca</i>）为国家二级重点保护野生植物，为了从繁殖生物学角度探讨合柱金莲木的濒危机制，为其保护和可持续利用提供科学依据，本研究对合柱金莲木的开花结实物候进行观测并利用微卫星分子标记测定其交配系统。结果表明：（1）成龄合柱金莲木植株的平均地径、平均株高和平均冠幅分别为0.70、129.67和81.98 cm，平均每株结花序15.56串。合柱金莲木于3月下旬至4月中上旬进入抽（花）序期，4月中下旬进入现蕾期，4月下旬至5月中下旬为开花期，5月下旬至8月中旬为果实发育期，8月中旬至10月上旬为果实成熟期。合柱金莲木的单花开放在1天内完成，其开花进程可分蕾松、初开、盛开和落花4个阶段，其花序的单花数约27朵/串，果序的蒴果数约18个/串，结果植株平均每株的种子数达5 881.68粒，种子量极大。（2）合柱金莲木的多位点异交率（<i>t</i><sub>m</sub>）和单位点异交率（<i>t</i><sub>s</sub>）分别为0.982和0.752，<i>t</i><sub>m</sub>><i>t</i><sub>s</sub>，说明在物种水平上合柱金莲木存在一定比例的近交，双亲的近交比例为0.230，其存在近交衰退（<i>δ</i>=4.332>0）。合柱金莲木在物种水平上的多位点相关度（<i>r</i><sub>pm</sub>）和单位点相关度（<i>r</i><sub>ps</sub>）分别为0.272和0.314，说明其物种内部存在明显分化的种群遗传结构，其异交子代间亲本相关性（<i>r</i><sub>p</sub>）为0.213，表明部分子代共享了亲本。交配系统中存在一定程度的近交可能是合柱金莲木濒危的重要因素之一。]]></description>
<pubDate>2024/2/26 17:40:35</pubDate>
<category><![CDATA[濒危植物遗传多样性]]></category>
<author><![CDATA[陈宗游，韦霄，柴胜丰，邹蓉，汪俊芳]]></author>
<guid><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230607&flag=1]]></guid><cfi:id>2</cfi:id><cfi:read>true</cfi:read></item>
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<title xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="text"><![CDATA[广西崇左叉叶苏铁野生和迁地保护种群的遗传多样性比较分析]]></title>
<link><![CDATA[http://gxkx.ijournal.cn/gxkx/ch/reader/view_abstract.aspx?file_no=20230608&flag=1]]></link>
<description xmlns:cf="http://www.microsoft.com/schemas/rss/core/2005" cf:type="html"><![CDATA[叉叶苏铁[<i>Cycas bifida</i> （Dyer） K.D.Hill]为国家一级重点保护野生植物，了解广西崇左叉叶苏铁野生种群和迁地保护种群的遗传多样性和遗传结构，可为其种质资源的保护及管理提供指导。本研究利用筛选得到的6对稳定且多态性良好的Simple Sequence Repeat （SSR）引物，对位于崇左的4个叉叶苏铁野生种群和迁至桂林的1个叉叶苏铁迁地保护种群共109个个体的遗传多样性和遗传结构进行分析。结果表明： 4个野生种群的观测等位基因数平均值为2.875，有效等位基因数平均值为1.796，Shannon信息指数平均值为0.637，观测杂合度平均值为0.363，期望杂合度平均值为0.373，说明广西崇左叉叶苏铁遗传多样性水平较低。迁地保护种群的观测等位基因数、有效等位基因数、Shannon信息指数、观测杂合度和期望杂合度分别为3.000、1.865、0.686、0.323和0.391，说明迁地保护能提高叉叶苏铁遗传多样性。遗传结构中群体间遗传呈中度分化（0.134），种群间遗传变异占25%，种群内遗传变异占75%，遗传变异主要来源于种群内。非加权组平均法（Unweighted Pair-Group Method with Arithmetic means，UPGMA）、主坐标分析（Principal Co-ordinates Analysis，PCoA）和Structure分析表明109份样品可分为2类，迁地保护种群ZWS和野外种群PR为一类，其余3个种群为一类。野生种群中MALL的群体遗传多样性最高（Shannon信息指数为0.711，期望杂合度为0.394），应将该种群作为重点保护单元进行保护。迁地保护种群ZWS的Shannon信息指数和期望杂合度均高于野生种群平均值，但Shannon信息指数略低于野生种群MALL，期望杂合度略低于野生种群MALL和YCLL。建议继续加强野生种群MALL和YCLL种群资源的引种工作，以便更有效地保护叉叶苏铁的遗传资源。]]></description>
<pubDate>2024/2/26 17:40:36</pubDate>
<category><![CDATA[濒危植物遗传多样性]]></category>
<author><![CDATA[邓丽丽，唐健民，邹蓉，杨一山，陈泰国，韦霄]]></author>
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